Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp39Q3TIX9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms