Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trappc13Q3TIR1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trappc13Q3TIR1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trappc13Q3TIR1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trappc13Q3TIR1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trappc13Q3TIR1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Trappc13Q3TIR1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc13Q3TIR1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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