Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RubcnlQ3TD16 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RubcnlQ3TD16 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms