Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rbp2Q08652 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rbp2Q08652 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms