Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn2Q08093 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms