Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AmbpQ07456 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms