Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnb1Q03717 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms