Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PrcdQ00LT2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms