Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms