Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SmsP97355 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SmsP97355 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SmsP97355 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SmsP97355 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SmsP97355 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SmsP97355 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SmsP97355 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SmsP97355 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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SmsP97355 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SmsP97355 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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