Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SgcgP82348 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SgcgP82348 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SgcgP82348 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SgcgP82348 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms