Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sparcl1P70663 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sparcl1P70663 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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