Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SbdsP70122 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SbdsP70122 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms