Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ube2kP61087 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms