Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms