Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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