Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LtbP41155 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
LtbP41155 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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