Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms