Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx2P31316 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms