Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms