Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Psmb9P28076 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Psmb9P28076 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Psmb9P28076 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Psmb9P28076 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Psmb9P28076 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms