Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CebpbP28033 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CebpbP28033 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CebpbP28033 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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CebpbP28033 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CebpbP28033 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms