Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PrkchP23298 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrkchP23298 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PrkchP23298 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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