Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms