Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prim1P20664 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prim1P20664 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms