Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
P18525 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
P18525 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
P18525 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms