Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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