Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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