Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RhoP15409 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RhoP15409 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RhoP15409 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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RhoP15409 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhoP15409 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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