Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scd1P13516 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scd1P13516 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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