Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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DmdP11531 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
DmdP11531 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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DmdP11531 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
DmdP11531 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DmdP11531 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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DmdP11531 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DmdP11531 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DmdP11531 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DmdP11531 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
DmdP11531 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
DmdP11531 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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DmdP11531 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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DmdP11531 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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DmdP11531 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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DmdP11531 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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DmdP11531 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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