Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P10404 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P10404 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P10404 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P10404 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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