Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cfdp1O88271 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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