Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
E2f6O54917 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms