Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Zmat3O54836 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms