Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DffaO54786 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DffaO54786 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DffaO54786 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DffaO54786 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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