Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Pkd2O35245 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pkd2O35245 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pkd2O35245 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Pkd2O35245 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkd2O35245 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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