Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcns1O35173 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms