Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20878L7N244 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20878L7N244 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20878L7N244 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20878L7N244 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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