Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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