Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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BC024978J3QPC3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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BC024978J3QPC3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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BC024978J3QPC3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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BC024978J3QPC3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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BC024978J3QPC3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
BC024978J3QPC3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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