Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Smim18J3QNP2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms