Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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Gm20830J3KML6 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Gm20830J3KML6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Gm20830J3KML6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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