Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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