Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms