Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Syce3B5KM66 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms