Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprbB2RU80 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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