Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rrn3B2RS91 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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