Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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