Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NhsB1AV60 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NhsB1AV60 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms